Sửa đổi quy định chi tiết thi hành Luật Thuế GTGT

Nội dung tập trung xử lý hai vấn đề lớn:

1. Quy định về thuế GTGT đối với sản phẩm nông, lâm, thủy sản ở khâu kinh doanh thương mại: Bổ sung quy định trường hợp không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT nhưng vẫn được khấu trừ thuế đầu vào(.Khoản 1 Điều 1 Nghị định 359/2025/NĐ-CP (bổ sung/sửa đổi Điều 4 Nghị định 181/2025/NĐ-CP).
2. Tháo gỡ vướng mắc trong hoàn thuế GTGT: Bãi bỏ điều kiện gây nghẽn trong công tác hoàn thuế và quy định chuyển tiếp cho các hồ sơ tồn đọng.

1. ĐIỂM KHÁC BIỆT NỔI BẬT NGHỊ ĐỊNH 359/2025/NĐ-CP VỚI NGHỊ ĐỊNH 181/2025/NĐ-CP
2. Bổ sung cơ chế "Không kê khai, tính nộp thuế nhưng được khấu trừ đầu vào" cho nông, lâm, thủy sản sơ chế (Khoản 1 Điều 1)

• Nghị định 359/2025/NĐ-CP:
• Doanh nghiệp, HTX nộp thuế khấu trừ bán cho Doanh nghiệp, HTX khác: Thuộc diện không phải kê khai, tính nộp thuế GTGT nhưng được khấu trừ thuế GTGT đầu vào.
• Bán cho các đối tượng khác (hộ, cá nhân kinh doanh, người tiêu dùng): Tính thuế GTGT theo mức 5%.
• Hộ/Cá nhân/Doanh nghiệp nộp thuế theo phương pháp trực tiếp: Áp dụng tỷ lệ 1% trên doanh thu khi bán sản phẩm này ở khâu thương mại.
• Chênh lệch/Khác biệt so với NĐ 181/2025/NĐ-CP:
• Trước đó tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP chưa làm rõ hoặc thiếu quy định bổ sung cụ thể khoản 1b Điều 4 đối với cơ chế không kê khai nộp thuế nhưng giữ quyền khấu trừ đầu vào cho chuỗi kinh doanh thương mại nông sản giữa các doanh nghiệp.

1. Bãi bỏ quy định gây vướng mắc trong hoàn thuế GTGT (Khoản 2 Điều 1)

• Nghị định 359/2025/NĐ-CP:
  • Chính thức bãi bỏ Khoản 3 Điều 37 và Khoản 3 Điều 39 của Nghị định 181/2025/NĐ-CP.
• Quy định chuyển tiếp gỡ vướng cho hồ sơ hoàn thuế tồn đọng (Khoản 2 Điều 2)

• Nghị định 359/2025/NĐ-CP:
• Các hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT đã nộp và được cơ quan thuế tiếp nhận trước ngày 01/01/2026 nhưng chưa ban hành Quyết định hoàn thuế (hoặc Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ thu NSNN) thì KHÔNG bắt buộc phải đáp ứng điều kiện "người bán đã kê khai, nộp thuế GTGT" đối với hóa đơn đầu vào đề nghị hoàn.
• Khác biệt so với NĐ 181/2025/NĐ-CP:
• Trước đây (theo logic kiểm tra của NĐ 181/2025/NĐ-CP và quản lý thuế), doanh nghiệp mua hàng chỉ được hoàn thuế khi người bán đã kê khai và nộp thuế GTGT vào NSNN. Điều này khiến nhiều doanh nghiệp bị ngưng trệ hoàn thuế do người bán bỏ trốn hoặc chưa hoàn thành nghĩa vụ nộp thuế.